Depois de escapar do ataque do monstro gigante Skull Gomora, Riku Asakura e seu parceiro Pega tropeçaram em uma base secreta situada a 500 metros de profundidade. Dado o Geed Riser e Ultra Capsules do sistema operacional Rem, ele se transforma em Ultraman Geed e se torna um herói inspirado em sua infância.